À la fin de l'année dernière, une nouvelle famille de coronavirus est apparue dans le monde entier en tant que membre de la terre Hwangju (Wuhan) protégée par Guan Yu dans les Trois royaumes, frappant le monde en seulement trois mois avec une propagation sans précédent. Bien sûr, le tableau clinique d'une infection virale est déterminé par la nature même du virus. Beaucoup d'anciens élèves le connaissent bien, mais nous avons compilé une connaissance de base du virus pour le rendre le plus facile possible. Pour de plus amples renseignements sur la biologie mécanique et moléculaire, veuillez consulter les références à la fin. En interprétant les références en particulier, il est important de garder à l'esprit que les données épidémiologiques de Wuhan, en Chine, comprennent des expositions redondantes dues à la propagation rapide des virus et des cas exceptionnels (valeurs aberrantes) dus à des niveaux élevés d'infection.
Le nouveau mutant Corona, qui portait divers noms comme Wuhan Corona et New Corona, a été officiellement nommé Corona 19 (COVID-19) pour l'exactitude de la recherche par mots clés. Il s'agit d'une souche sous-type du virus de la couronne, l'une des causes communes des rhumes saisonnières que nous avons appris des étudiants de premier cycle. Les sous-types qui causent principalement la grippe pandémique chez les humains comprennent la corona 229E et l'OC43. Dans le passé, en plus de ces coronas communs, il se peut qu’il y ait eu l’émergence intermittente de coronas mutants, mais l’absence de techniques d’inspection ne pouvait confirmer. Toutefois, la mise au point de techniques d'analyse des virus de la biologie moléculaire, en particulier les techniques de la réaction en chaîne de la transcriptase inverse (RT-PCR), a facilité l'identification immédiate de nouveaux virus à ARN. En conséquence, plusieurs variantes de la couronne ont été signalées depuis les années 2000. Les virus Corona qui ont été identifiés à ce jour comprennent le CoV-SRAS (2003), le HCoV NL63 (2004), le HKU1 (2005), le MERS-CoV (2012) et le COVID-19 (SARS-CoV-2). Il y en a. Parmi ceux-ci, le SRAS et le MERS étaient les plus connus. Le terme COVID-19 a été utilisé pour unifier le nom de ce virus de la couronne périodique. Le fait d'être nommé comme COVID-19 signifie que l'éclosion se produira périodiquement à l'avenir. Si une nouvelle couronne apparaît en 2022, elle s'appelle COVID-22.
COVID-19, un membre du virus de la couronne, appartient aux Orthocoronavirinae, qui est caractérisé par la muco-affinité, et est le plus gros virus à ARN qui infecte le corps. Les gènes positifs à ARN monocaténaire ont une taille de 27-34 kbase et une taille physique de 120-140 nm. Sa coquille phospholipidique provient de la membrane cellulaire de l'hôte. Cette bicouche phospholipidique est la principale caractéristique des infections respiratoires, qui se propagent par des mutations. En effet, la membrane phospholipidique augmente la tolérance aux mutations dans les protéines étrangères du virus et augmente la probabilité d'éviter l'immunité. Dans le cas du virus de la couronne, la coquille des phospholipides est densément remplie de protéines d'épi collantes qui ont une affinité pour le mucus respiratoire. Lorsqu'on l'observe au microscope électronique, sa forme ressemble à celle que l'on observe au sommet de la couronne, et on l'appelle le virus Corona.
Les mutations du virus se produisent au hasard et ont une certaine probabilité par nombre de multiplications. Par conséquent, pour qu'une variante favorable soit sélectionnée et émerge sous forme de nouveau virus par mutation, un hôte doit être pleinement développé. Dans le cas de la couronne, la chauve-souris est l'hôte. Comme vous le savez, comme les chauves-souris sont des mammifères, la barrière virale transfrontalière et hétérogénéité est très faible. Les chauves-souris ont un métabolisme élevé parce qu'elles sont à la fois des mammifères et des bêtes volantes. Cette caractéristique permet au virus de la couronne de se multiplier à long terme sans activer l'immunité, ce qui donne divers virus mutants. Lorsqu'un nouveau mutavirus provenant d'une chauve-souris traverse une espèce et infecte les humains, ceux-ci rencontrent une toute nouvelle structure d'antigène qu'ils n'ont jamais rencontrée auparavant. En d'autres termes, l'immunité collective est nulle et le risque d'une pandémie mondiale augmente. Cependant, comme les humains entrent rarement en contact direct avec les chauves-souris, ils ont besoin d'un milieu intermédiaire (hôte d'amplification) pour relier l'infection de la chauve-souris à l'humain. Les chats dans le SRAS et les chameaux dans le MERS ont joué ce rôle. Le COVID-19 n'est toujours pas certain de cet intermédiaire. Il y a aussi une hypothèse selon laquelle il s'agit d'un serpent ou d'un poisson, mais il est moins probable qu'il serve de médiateur intermédiaire parce qu'il est éloigné des mammifères. Pire encore, à l'instar de l'épidémie du sous-type d'Ebola, le virus allemand Malberge, il est possible qu'il soit arrivé à un être humain tout de suite en expérimentant des chauves-souris dans un laboratoire de biotechnologie à Wuhan.
Dans le cas de COVID-19, le taux de propagation est toujours en cours, de sorte qu'il est difficile d'obtenir des statistiques épidémiologiques précises, mais les données de la Corée, qui sont testées rapidement et en profondeur, montrent que le taux de mortalité sera d'environ 1 % ou moins, et de 0,5 % dans les cas témoins. On s'attend à ce qu'elle soit un peu plus élevée que le taux de mortalité due à la grippe. Le taux de mortalité était de 7 % pour le SRAS et de 34 % pour le MERS. La relation inverse entre le taux d'infection et la létalité est due à la nature des infections virales, qui ne permettent qu'une transmission directe entre les hôtes. Dans le cas du système MERS, le taux de mortalité est très élevé et il est difficile à propager car il limite la vie quotidienne de la personne infectée. Cependant, dans ce cas de COVID-19, beaucoup de gens passent comme un rhume, donc il a de bonnes caractéristiques de propagation. Cela est dû au fait que, même aux yeux du virus, l'hôte doit maintenir la vie quotidienne le plus possible au profit de ses gènes.
Cependant, ces propriétés mécaniques à elles seules ne rendent pas entièrement compte de la forte infectivité de COVID-19. Tous les virus respiratoires doivent avoir une affinité mucus. Si vous n'adsorberez pas au mucus, vous risquez moins de pénétrer dans les cellules épithéliales respiratoires. Cette affinité mucus est acquise par la portion de pointe de la couronne mentionnée plus haut. La nouvelle couronne devrait être essentiellement une variante de ce pic. Cette région est reconnue par les cellules immunitaires de l'organisme, de sorte qu'en l'absence de mutation, elle est rapidement éliminée par l'immunisation. Dans le cas de COVID-19, les pics n'étaient pas seulement mutés, mais l'affinité du mucus était environ 50 fois plus élevée que dans les coronas précédents. En d'autres termes, la mucoadhésion est améliorée et les pires mutations peuvent être évitées. En raison de cette propriété moléculaire biologique, même lorsqu'une petite quantité de virus entre en contact avec le mucus, la probabilité d'infection de l'épithélium respiratoire augmente et la prolifération est active dès le début. En d'autres termes, contrairement aux virus antérieurs, qui ont atteint un niveau qui peut être infecté par d'autres après une certaine évolution clinique, il est plus probable qu'il se propage à d'autres au début de l'infection.
Comme le COVID-19 commence aussi par les infections épithéliales respiratoires, il n'y a pas de caractéristiques cliniques qui le distinguent des autres rhumes, particulièrement des infections grippales. Toutefois, il est fort probable qu'il y aura une différence dans l'évolution du tableau clinique (l'ordre dans lequel les symptômes se développent avec le temps) en raison des caractéristiques moléculaires biologiques. La grippe commence souvent par des infections nasales par des aérosols en raison de la taille et des caractéristiques des récepteurs du virus. D'autre part, le COVID-19 est souvent le début d'infections buccales par éclaboussures en raison de sa grande taille et de ses caractéristiques de pointe. Le virus qui pénètre dans la cavité buccale infecte les cellules épithéliales respiratoires du larynx et commence sa première prolifération. Les virus ayant une faible affinité pour le mucus pénètrent habituellement dans la cavité buccale avec de la nourriture ou de l'eau. Mais le COVID-19 a une forte affinité mucus, qui infecte les cellules épithéliales respiratoires sans être lavé. L'une des caractéristiques cliniques de COVID-19 est qu'il a moins d'écoulement nasal et moins de toux sèche et de douleurs abdominales. Bien sûr, le COVID-19 ne signifie pas qu'un écoulement nasal n'est pas inconditionnel. L'infection peut avoir commencé par un aérosol ou le virus peut passer de la gorge à la cavité nasale au fur et à mesure que l'infection progresse. Un écoulement nasal ne peut pas écarter la possibilité d'un COVID-19, mais si le premier symptôme d'un rhume est un mal de gorge ou une toux sèche, il y a amplement de doute. La fièvre accompagnée présente des différences individuelles selon l'état immunitaire. Toutefois, en raison de la nature du virus à croissance rapide, la fièvre précoce est souvent accompagnée.
La confirmation est basée sur la RT-PCR, comme la plupart des virus de nos jours. Cette technique est rapide et précise, mais il est important de tenir compte du fait que les jugements négatifs prennent du temps parce que les fragments de gènes peuvent demeurer pendant un certain temps même s'ils sont trop sensibles et ne présentent pas de croissance virale. En d'autres termes, tous les positifs à la RT-PCR ne sont pas possibles. Sur le plan clinique, la confirmation de la modalité d’imagerie est un déterminant important du pronostic et a une grande valeur diagnostique.
Enfin, si l'on examine la nature de la propagation de l'infection, les particules virales présentes dans l'aérosol ne dépassent pas facilement le niveau requis en raison de la grande taille des particules du virus. Autrement dit, le masque n'est pas important à l'extérieur ou dans des endroits bien ventilés. Toutefois, si vous avez quelqu'un qui continue de tousser à l'intérieur, comme dans une chambre d'hospitalisation, vous devriez supposer que la concentration d'aérosol atteint rapidement des niveaux dangereux. Dans bien des cas, seul le masque est considéré lorsque l'infection se propage à travers les gouttelettes, mais dans le cas de la couronne, le contact avec les sécrétions par les mains est plus important. Dans les hôpitaux, la poignée des toilettes est la principale source d'infection. Ce n'est pas utile si vous devez vous laver les mains et toucher une poignée sale.
Par conséquent, la salle de bain de l'hôpital est préférable de pousser sans poignée et s'il existe une structure possible, il vaut mieux ne pas avoir de porte du tout. Dans le cas de COVID-19, qui se caractérise par des gouttelettes infectieuses élevées, il est dangereux de se parler, de manger ou de boire. En plus de l'habitude de ne pas vous toucher le visage avec vos mains, il est important de vous laver les mains souvent. Puisqu'il s'agit d'un virus à coquille phospholipidique, il est efficace même avec un savon comme agent tensioactif même sans utiliser un désinfectant spécial pour les mains. On dit que le virus prévient, et non guérit. COVID-19 conclut en soulignant l'importance du mode de vie de chaque individu dans la prévention des infections en raison de la forte probabilité de transmission par contact étroit. Je vous remercie.
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(Fourni par Prof. Chul-Hyun Ju, Département de microbiologie, Collège médical d'Ulsan)
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